Ordenar 2 array en 1

[Triby]

1- Ordena la consulta por id y value "ORDER BY id, value"
2- Crea un sólo array, con índice de acuerdo a object_sid

Código PHP:

$registros = array();
while(/* lectura de cada registro de la consulta */) {
    // Estoy suponiendo que las variables son los campos de tu tabla
    // Primero verificas que exista el índice en el arreglo
    if( !isset($registros[$object_sid])) {
        // No existe, la creas en blanco
        $registros[$object_sid] = array('nombre' => '', 'email' => '');
    }
    // Ahora sólo vas agregando nombre o correo, segun el caso
    if($id == 'referencia_comp:nombre_ref') {
         $registros[$object_sid]['nombre'] = $value;
    } else {
         $registros[$object_sid]['email'] = $value;
    }
}
 

Con eso ya te quedaría el array correcto, pero en vez de ID 0, 1, 2 y 3, serán los números correspondientes de object_sid

Supongo que algo tendrás planeado hacer con los registro que tienen value vacío.