Mira, no tengo mucho tiempo libre pero tratare de ayudarte, pero para eso necesito que tu me
"ayudes a ayudarte".
Para eso se necesita ver el script completo para saber como se convierte.
Código PHP:
<a href='noticia.php?".$auxTipo."id=$id'>
entonces es importante ver desde el inicio. Como se conecta a la base de datos, como obtienes la información de id.
Como dices que en una secciones ocurre y en otras no mira que tienen en común cuando ocurren esos errores. A mi me late que esos tiene que ser un problema de acentos.
¿Le aplicaste previamente a los campos que llamas filtros de url amigables?
La tarea es tuya, no mia. Revisa eso y ahí podras empezar a descartar errores.