En el código fuente tenés la respuesta
Código:
<script language="JavaScript">
TargetDate = "04/18/2013 11:59 PM";
BackColor = "white";
ForeColor = "black";
CountActive = true;
CountStepper = -1;
LeadingZero = true;
DisplayFormat = "%%D%% Días, %%H%% Horas, %%M%% Minutos, %%S%% Segundos.";
FinishMessage = "Feliz año nuevo!!!";
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<script language="JavaScript" src="http://ciudad-blogger.googlecode.com/files/countdown.js"></script>
cambias el mesaje y al displayFormat le quitás los dias y los segundos