Hola:
¿En qué cabecera? ¿en la SOAP o en la HTTP?
Si es en header, aquí
https://www.google.es/search?q=jax+ws+http+header hay algunos ejemplos, a ver si te vale alguno.
Si es en SOAP, lo normal es que sean cosas estándar como WS-Addressing, WS-Security y jax ws suele tener soporte para ello.
Se bueno.