¿Cómo cambiar el orden de filas de una matriz ?

[Xerelo]

Es sencillo, lo que necesitas entender es qué es una matriz en java.

Una matriz en java no es una matriz, es un array de arrays.

En tu caso, un array que contiene tres arrays de tres posiciones.

0. {1,2,3}
1. {4,5,6}
2. {7,8,9}