Son cosas distintas... el formulario envía los datos del cliente al servidor, una vez los tienes en el servidor puedes hacer lo que quieras con ellos ... guardarlos en una bbdd y/o retornarlos al cliente una vez formateados, el formato de retorno puede ser html o pdf o cualquier cosa que el cliente pueda leer.
Básicamente es lo mismo en todos los casos lees los datos del $_POST e intercalas etiquetas propias del lenguaje o del formato en cuestión.
Si sabes leer los datos del $_POST cualquier ejemplo de los que hay en el
api de fpdf te ayudará a crear el tuyo.