Cortar un archivo con php

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Hola a todos, tengo una duda, que es mas bien que creo que lo que intento no se puede hacer con php, pero bueno por si alguien puede aclararme la duda.

Tengo una aplicación web que me tiene que subir un archivo a un servidor para cargar después en Background unos registros en una BBDD. el problema que los archivo (CSV) pueden llegar a tener un tamaño muy considerable, ya he aumentado el tamaño máximo que acepta mi servidor apache, pero aun así sigo teniendo muy casualmente archivos mas grandes, con lo cual me gustaría saber si se puede cortar ese archivo en dos mientras se sube, para que mi apache lo permita y después trabajar con los dos ficheros en background.

Supongo que no se podrá hacer, ya que php trabaja de la parte del servidor, y este no puede hacer nada con los fichero si aun no los tiene en memoria..

Gracias!!