Ok, activa los errores modificando el php.ini en el servidor o con los comandos en php en el propio documento.
Código PHP:
ini_set("display_errors", 1);
error_reporting(E_ALL);
Estos comandos pueden o no funcionarte dependiendo de la configuracion del servidor.
Con respecto a si se puede usar el isset dentro del while, te aseguro que es la manera de validar que realizo constantemente me parece mas optima que un for en estas situaciones mas que nada porque en caso que no exista ningun registro no genera notice. Y la iteracion avanza al final del while como bien sabras ($n++).
haz eso y haz un print_r al array de notas a verque está obteniendo.
Si solo muestra array{} ejecuta la consulta directamente en el phpmyadmin a ver que sucede. Ve probando.