Asi es, y lo mismo puedes hacer dentro de los include mismos...
Es decir que si incluyes la pagina clientes.php, dentro de ella puede haber tambien otro include dependiendo de lo que se haya seleccionado...
princilal.php?seccion=clientes&contenido=estadodec uenta
Yo suelo hacerlo con valores numericos y claves no tan simples (para evitar que los curiosos le comiencen a cambiar valores en el querystring...
principal.php?modo=1&pg=3&catid=12