no conozco ZendStudio, pero imagino que debes de al menos copiar el core del ZendFW en algún sitio y de ésa forma el ZendStudio debe de tener unos parámetros para establecerlo, además de la versión (si soporta ZendFW 1.x o 2.x)
Lo ideal es que revises las opciones de ZendStudio y verifiques que te pide, lo usual es que cuando trates de crear un proyecto te lanze un error tipo: ZendFW no localizado por ejemplo