Php buscará el archivo a incluir iniciando en la carpeta del script que se está ejecutando, en este caso,
ejemplo.php.
Te recomiendo usar una constante para establecer la ruta de tu carpeta raíz y puedas incluir cualquier archivo sin importar la estructura de tu proyecto.
Ejemplo:
Código PHP:
Ver original// en ejemplo.php
// En cada include:
include RAIZ . '/A/A.class.php';
// Si estás en A.class.php, esto funcionará:
include RAIZ . '/BD/Conexion.class.php';