Pues tienes varias formas, la primera :
Inicio- - - > Ejecutar - - - > cmd
ve hacia la unidad que represente el usb y escribe
attrib /d /s -r -s -h -a
Este comando hará que todos los archivos sean visibles otra vez
Ahora accede al usb por el explorador y elminina todos los .lnk que te ha generado el troyano, también verás carpetas con números por nombre además de la famosa $_Reciclerbin que es tb creación del virus.
Luego bájate un antivirus para el usb como por ejemplo
este
Y ya está
