Algunas formas de hacerlo... ahi vas viendo cual te sirve mas
Cita: Options +FollowSymLinks -Indexes
DirectoryIndex index.php
RewriteEngine on
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule ^(.*)$ index.php/$1 [L,QSA]
Asi exacto lo hace CodeIgniter......