No generes los frames con porcentajes. Hazlo aplicando un número de px fijo para que no cambie el tamaño sea cual sea la resolución del navegador o la versíon de este.
Por ejemplo: ( una pagina en tres frames).
<frameset cols="120px,*,">
<frame name="izquierda" src="xxx" noresize frameborder="no" border=0
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