..deberias usar los Event Handler del DOM Level 0...o sea...
    
Código Javascript
:
Ver originalvar boton = document.getElementById("Boton");
boton.onclick = function(){
   // aca tu codigo
}
  
...ademas si quieres evitar la propagacion de la accion del boton, deberias agregar return false    
Código Javascript
:
Ver originalvar boton = document.getElementById("Boton");
boton.onclick = function(){
   // aca tu codigo
   return false;
}