Gracias #pateketrueke la solución fue quitar el   
Código PHP:
Ver original- require("../mod_configuracion/conexion.php"); 
Código PHP:
Ver original- $bd_host = "localhost"; 
- $bd_usuario = "root"; 
- $bd_pass = "r"; 
- $bd_base = "bd"; 
- $bd_port=""; // este vacio 
al parecer ese require incluia una cabecera que hacia que no imprimiera bien el pdf