La opción del config.ini suena bien si centralizas todo el manejo de sesiones en un script/función/class/etc. ya que si debes hacer los cambios archivo por archivo resulta demasiado.
Y lo que está en la linea que comentas se resuelve igual, debes colocar lo mismo en cada script que haga uso de sesiones, pero si tienes todo disperso entonces deberías mejorar esa parte primero.