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Iniciado por diagoras 
los lee pero no los escribe da error de permisos, he mirado y la mayoria de hosting tiene el mod_php en lugar de cgi ya que si se usa cgi se debe usar la ruta midominio.com/cgi-bin y eso como que no y el proveedor de dominios no me deja apuntar directamente al cgi
Que va, eso depende del hosting, un hosting, cpanel que es de los más usados usa suphp es más seguro, un hosting con mod_php es fácilmente vulnerable, plesk usa fcgid por defecto, directadmin no recuerdo prero creo que usan suexec también.
Por seguridad en un hosting compartido no se debe usar mod_php, aunque algunos dejan la seguridad de lado para ganar en velocidad.
En cuanto a lo de dominio.com/cgi-bin es solo si corres aplicaciones en perl, python etc con fastcgi no hace falta eso.