Hola:
Crea un panel o ventana y ponle layout null (metodo setLayout(null)). Fíja a ese panel o ventana un tamaño con setSize().
Mete dentro los dos botones con el método add(boton1) y add(boton2). A los botones deberás darles tamaño y posición dentro del panel con el método boton.setBounds(x,y,ancho,alto).
Para hacer que se muevan, en un bucle vete cambiando la posición de cada boton con setBounds() y obliga a un repintado del panel/ventana con panel.updateUI().
Otra alternativa es usar gráficos. Aquí tienes un ejemplo
http://www.chuidiang.com/java/grafic...ico_simple.php
Se bueno.