Lo que buscas es IN() de mysql el cual los parametros debes pasarselos separados por "," coma
en el manual del PHP hay este ejemplo sobre la funcion implode() "La cual te ayudara a separar por , los datos dentro de un array"
Ejemplo:
la consulta te quedaría algo como WHERE site_id IN(".$separado_por_comas.") la consulta te devolvera todos los datos donde site_id este dentro de lo establecido en la funcion IN()