Exacto, tú mismo te has medio respondido, la primera opción resulta excesiva y con sobreoptimización, si ya tienes el nombre del dominio en el mismo, ¿por qué repetirlo en cada sección?
Ten en cuenta que aunque pongas una y otra vez el nombre del dominio en cada carpeta, eso no te garantiza nada, hay otras formas de hacerlo, ya sea en encabezados o en los títulos de cada página:
Código HTML:
<title>Clientes - Nombreempresaopiniones.com</title>