Hola.
Supongo que te referís a algo así:
Código PHP:
$consulta ="SELECT subject, tid, username FROM temas WHERE fid <> 45 ORDER BY tid DESC LIMIT 20";
Ahí estarías obteniendo todos los temas excepto aquellos que pertenecen a la categoría cuyo ID es 45.
Espero que te sirva. Saludos.