Ponle value
<input type="checkbox" name="seleccion1" value="true">A<br/>
<input type="checkbox" name="seleccion2" value="true">B<br/>
en tu jsp, si el input está checkeado recibirás un seleccion1=true o seleccion2=true, y no recibirás nada del otro.
http://www.w3schools.com/tags/att_input_checked.asp
Se buena.