No es algo que se te pueda contar aquí en dos patadas, hay muchos tutoriales en internet sobre JTree y sobre base de datos.
Aquí tienes uno sobre cómo hacer el JTree
http://www.chuidiang.com/java/JTree/...mple-jtree.php Tendrías que rellenar los nodos con cosas que leas de base de datos.
Aquí tienes cómo leer de base de datos (MySQL)
http://www.chuidiang.com/java/mysql/EjemploJava.php
Vete intentándolo y si te sale alguna pega concreta, vuelve a preguntar.
Se bueno,