muchas gracias ya me funciono asi 
dejo el codigo por si alguien le sirve  
Código PHP:
Ver original<html>
    <head>
    <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" />
    <script language="JavaScript" src="http://code.jquery.com/jquery-1.10.2.min.js"></script>
    <script type="text/javascript">if(typeof jQuery==='undefined'){document.write(unescape("<scri"+"pt src='js/jquery-1.3.2.min.js' type='text/javascript'></scri"+"pt>"));}</script>
    <style>
          html {  background-image: url(images/glowcolor.png); }
     .alerta {
     position: fixed; /* Le damos el valor Fixed para que flote */
     background: #FFF; /* Color de fondo de la capa */
     width: 100%;
     height: 100%;
     top: 0;
     left: 0;
     z-index: 999;
     display:none;
    }
    .flota{
     opacity:1.0; /* opacidad del 60% */
     filter:alpha(opacity=100); /* Opacidad para IE8 y earlier */
     background: rgba(255, 255, 255, 0.50); /* Color de fondo de la capa */
     border-radius: 8px; /* Redondeado */
     box-shadow: 0px 0px 0px 1px black, 5px 5px 14px black; /* Sombra exterior */
     position:absolute;
     left:50%;
     top:50%;
     margin-left:-112px;
     margin-top:-70px;
     width:224px;
     height:140px;
     z-index:1;
     color:#000;
    }
 
    .flota h2 {
        margin:auto;
        text-align:center;
    }
    .flota span {
        text-align:center;
        width:100%;
        position:inherit;
        margin-top:20%;
        font-size:36px;
    }
 
    .close{
     position: absolute;
     display: block;
     top: 0;
     right: 2;
     cursor: pointer;
     background: url(images/eliminar.png) 0px 0px no-repeat; /* Imagen del boton */
     width: auto;
     height: 30px;
     overflow: hidden;
    }
    </style>
    <script>
        $(document).ready(function() {
            $(".close").click(function(){ //Le decimos que al dar click en ".close"...
                $(".alerta").hide("slow"); //Oculte el contenedor ".overlay" lentamente(slow)
                window.clearInterval(mytime); // Delete interval
                $.ajax({ type: "GET",url: "expira.php" });
                display_c(120); // Redefine time for new session expire
                event.preventDefault(); // Anulamos el enlace...
             });
        });
    </script>
    <script type="text/javascript">
    function display_c(start){
    window.start = parseFloat(start);
    var end = 0 // change this to stop the counter at a higher value     var refresh=1000; // Refresh rate in milli seconds
    var timeShow = 119;
    if(window
.start 
>= end ){         if(window.start <= timeShow){
            $(".alerta").show();
        }
        mytime=setTimeout('display_ct()',refresh)
    }
    else {
       window.location="../login.html";
    }
    }
 
    function display_ct() {
    // Calculate the number of days left
    var days
=Math
.floor(window
.start 
/ 86400);     // After deducting the days calculate the number of hours left
    var hours 
= Math
.floor((window
.start 
- (days 
* 86400 ))/3600)     // After days and hours , how many minutes are left
    var minutes 
= Math
.floor((window
.start 
- (days 
* 86400 ) - (hours 
*3600 ))/60)     // Finally how many seconds left after removing days, hours and minutes.
    var secs 
= Math
.floor((window
.start 
- (days 
* 86400 ) - (hours 
*3600 ) - (minutes
*60)))  
    var x = minutes + ":" + secs + " Minutos ";
 
 
    document.getElementById('ct').innerHTML = x;
    window.start = window.start - 1;
 
    tt=display_c(window.start);
    }
        setTimeout('display_ct()',refresh);
    }
    </script>
    </head>
    <body onload="display_c(120);">
    HOLA
    <div 
class="alerta" id
="busca" ><!-- Mostrar div DURANTE 
10 min de inactividad mientras este oculto
-->         <div  class="flota" style=" width:397px; height:244px; ">
            <div class="close">
                <a href="#">Cerrar</a>
            </div>
            <h2>La sessión caducara en </h2>
    <span id='ct'></span>
      </div>
    </div>
 
    </body>
    </html>