Sólo te falta volver a poner a 0 la variable $i cuando ya has mostrado la noticia!
Código PHP:
if ($i == 5){ //Cada 5 noticias aparecerá una otica automática
print "NOTICIA AUTOMATICA"
$i=0; //sin esta parte, tu varible la siguiente vez sería 6, y nunca más entraría aquí.
}