Recuerda que comparas fechas no texto ni numeros espero esto te ayude. He tratado de organizarte un poco tu codigo.
Código PHP:
$fechaActual = date('d/m/y');
echo $fechaActual . ' <br />;
$dia = date('d');
$mes = date('n');
$yy = date('y');
$mv = $row_consulta['Mes'];
$mv2 = date('n', strtotime($mv));
$dv = $row_consulta['DiaVence'];
echo $dv . '<br />;
$fechaVence = new DateTime('01/02/14'); // PROBANDO
echo date_format($fechaVence, 'd-m-y') . '<br />';
echo $fechaactual > $fechavence ? 'Aplica Cargo' : 'Sin Recargo';
echo $mes > $dv ? 'Comparacion 2 Aplica cargo' : 'Comparacion 2 Sin recargo'