Optimización de BBDD

[gnzsoloyo]

Primero: No se deben realizar posts simplemente para subir el thred en la página. Eso está expresamente prohibido en las Políticas de Uso.

Segundo, y yendo a tu problema, con la descripción que haces es casi imposible intentar una optimización, porque no sabemos qué representa ese formulario, ni tampoco qué datos contienen esos 400 campos, y por sobre todas las cosas, sin saber para qué es ese sistema es imposible decirte si te conviene una estructura basada en taxonomías, o realmente construir una base de datos relacional (aclarando que no son la misma cosa).
Por lo que parece, estás suponiendo puedes aplicar una base como la que Wordpress usa para sus estructuras, pero eso no es una base de datos relacional, sino otra cosa, y sólo tiene utilidad si se pretende tener flexibilidad de diseño en las interfases, pero no respeta el modelo E-R, y se paga con performance de consultas (baja optimización).
En otras palabras, es útil para contextos de baja complejidad de datos, pero si quieres una base optimizada... no sirve.

Descríbenos al menos conceptualmente que tipo de cosas se procesan con ese formulario, y cual es el objetivo final, es decir, si sólo queda en el formulario, o luego de eso dependen otros procesos y sistemas.