Tu problema: [URL="http://es.wikipedia.org/wiki/C%C3%B3digo_spaghetti"]código spaghetti[/URL]
Mira qué fácil:
Código PHP:
<?php
//conexión a la base de datos
$link = new PDO('mysql:host=localhost;dbname=basededatos', 'user', 'password');
$st = $link->prepare('SELECT MAX(folio) ultimo FROM registro WHERE id=?');
$st->execute($row_abc['id']);
$ultimo = $st->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC)[0]['ultimo'];
?>
Folio:<input name="folio" id="nombrecaja" type="text" class="input3" size="15" value="<?= $ultimo ?>" />