Toniveas y todo los demás encontré la solución aunque puede ser tarde, pero seguro a alguien mas le pueda servir.
la idea es crear una Variable que cambie la letra reservada $.
Esto sirve para conflicto no solo con Prototype, también con otros.
acá el ejemplo:
Código Javascript
:
Ver original// Evita conflicto con otro codigo JS (no necesariamente prototype)
// que use la llamada $(...)
var $j = jQuery.noConflict();
$j(document).ready(function() {
// Aqui dentro, hacer las llamadas al codigo js
// con JQuery, como por ejemplo..
$j('#piepag').css({left: '0px'});
});
Y este esta es la fuente: https://www.teslatechnologies.es/jquery-evitar-conflicto-codigo-javascript/