Pues sii consultas el un manual básico de SQL verás que simplemente debnes en ese caso indicar en las consultas cuál es la base de pertenencia:
Código SQL:
Ver originalSELECT A.*, B.*
FROM base1.Tabla1 A INNER JOIN base2.tabla2 B ON A.id_tabla2 = B.id_tabla2
WHERE ...
Todos los DBMS respetan ese mismo esquema.
Por supuesto, para poder hacer ese tipo de consultas, el user que utilices debe tener permiso para leer las tablas de ambas bases...