Gracias por vuestra ayuda, he conseguido lo que queria, comprobar que lo que se introduce son numeros, os muestro el codigo a ver que os parece.
    
Código Javascript
:
Ver original<script type="text/javascript">
 
        var total;
        var num1 = Number (prompt ("Introduce el primer numero"));
        
            if (isNaN(num1)){
                do {
                var num1 = Number (prompt ("No es un numero, vuelve a introducir el primer numero"));
            } while (isNaN(num1));
            }
 
        var num2 = Number (prompt ("Introduce el segundo numero"));
 
            if (isNaN(num2)){
                do {
                var num2 = Number (prompt ("No es un numero, vuelve a introducir el segundo numero"));
            } while (isNaN(num2));
            }
        
        total=num1*num2;
 
        alert("El resultado es " + total);
 
                
</script>
  
Un saludo!!