Posición y dimensiones

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Lo que yo recomiento es usar porcentajes y utilizar tanto padding, margin, border y el que sea necesario, pero al usar porcentajes queda a tu desición si deseas usar padding como parte del ancho y largo total del objeto o no. Me explico mejor: El padding y el border por defecto no son parte del ancho ni largo, es decir si quieres que un elemento ocupe toda la pantalla lo lógico sería ponerle width:100%; height:100%; pero si le agregas un padding y un border el objeto se "saldrá" de la pantalla. Soluciona esto con box-sizing:border-box;
Para las fuentes y anchos de línea yo recomiendo totalmente usar em. Puedes buscarte mucha información al respecto googleando "em vs px". Si tienes preguntas no dudes en hacerlas.