Hola:
Justamente opener es desde una ventana popup la referencia a la ventana "abridora"... ojo que si se tratase de un iframe (por ejemplo con alguna librería que simule ventanas emergentes o te mientan diciendo que se trata de ventanas modales), en ese caso se trataría del objeto parent...
Bastaría que hubiese definida en la ventana superior alguna función que modificase el formulario con los checkboxes como parámetro, y en la ventana hija al terminar la selección llamar a esa función precedida por "opener"... ejemplo:
opener.elegir(chk);
Saludos