Movido a PHP.
Cita: Puede que esa variable sea el motivo de que la fecha aparezca con ceros?
Exactamente. Tu estás suponiendo que la funcion time() devuelve un Datetime que MySQL pueda usar, y que MySQL "dialoga" con PHP. Ninguna de las dos cosas es cierta.
MySQL no entiende las variables de PHP. A la base llega una cadena de texto con la consulta. No es lo mismo.
Si te tomas el trabajo de hacer un
echo a la query que se genera verás que debe estar poniendo '03-25-2014', lo que es inaceptable para MySQL.
Deberías usar date_format()
Pruebalo así y veamos: