Revisando el resto de la aplicación, me di cuenta que lo que está buscando para referencia de la entidad es el archivo .orm.yml
No se muy bien qué hice diferente al generar la entidad, pero ahora solicita en todas que exista el archivo correspondiente .orm.yml en Resources/Config.
Según pude ver, esto está configurado en DependencyInjection/ProyectoComisionExtension.php
Mi idea ahora, es encontrar dónde es llamado este archivo para modificar y continuar manejando la definición de entidades directamente en el archivo .php de la entidad sin necesidad de los .orm.yml
Me desconcierta porque no sé qué fue lo que hice de diferente al generar al entidad que generó este conflicto, pero así están las cosas en mi código
En cuanto lo solucione, comento.
Muchas gracias!