Cita:
Iniciado por masterpuppet 
Lo entiendo, lo que no se si tu tienes claros los conceptos de owning side, inverse side & cascade(algo básico si quieres persistir relaciones), en todo caso postea las entidades completas.
Saludos.
Código PHP:
Entity Conductor
/**
* Conductor
* @ORM\Table(name="conductor")
*/
class Conductor
{
...
/**
* @var \Doctrine\Common\Collections\Collection
*
* @ORM\ManyToMany(targetEntity="Car", mappedBy="conductor")
*/
private $car;
......
.....
Entity Car
/**
* Car
* @ORM\Table(name="car")
*/
class Car
{
/**
* @var \Doctrine\Common\Collections\Collection
*
* @ORM\ManyToMany(targetEntity="Conductor", inversedBy="car")
* @ORM\JoinTable(name="car_conductor",
* joinColumns={
* @ORM\JoinColumn(name="car_id", referencedColumnName="id")
* },
* inverseJoinColumns={
* @ORM\JoinColumn(name="conductor_id", referencedColumnName="id")
* }
* )
*/
private $conductor;