Enlazar proyectos autogestionados parece que es no solo lo más lógico sino lo más coherente, pero claro esta... antes de hacer este tipo de acciones debemos plantearnos las preguntas que se podría llegar a plantear un técnico de webspam de Google al contemplar nuestros contenidos:
1.- ¿Dónde aparecen esos enlaces?
2.- ¿Aportan o refuerzan la información de la página?
3.- ¿Existe una clara manipulación de los rankings de clasificación?
4.- ¿Realmente esas páginas enlazadas tratan de los mismos temas o similares?
5.- Como usuario ¿mi experiencia sería positiva tras visitar esos sitios o todo lo contrario?
Como te comenta @Daniel Ulczyk, este tipo de practicas incluso pueden llegar reforzar tu posicionamiento a rasgos generales en otros motores de búsqueda como BING, pero en Google las cosas han evolucionado hacía un punto más o menos acertado en el que este tipo de actuaciones son más controladas.
Si has respondido afirmativamente a la gran mayoría a un número más bien elevado de las preguntas anteriores, al margen del texto de ancla que determines como correcto para enlazar esas páginas, poco riesgo o problema pueden sufrir tus sitios de sufrir una penalización.