consulta dos tablas y hacer operaciones segun su resultado

[Geghnar]

Por lo que he entendido, yo probaría con esto, suponiendo que Rem sea el número de factura y sea común en ambas tablas a los partes y cantidades que queremos comparar:

Código PHP:

  $conn=mysql_query("select TABLA1.Parte as PARTE1, TABLA1.Cantidad as CANT1, TABLA2.Num_Parte as PARTE2, TABLA2.Cantidad as CANT2 FROM TABLA1, TABLA2 WHERE TABLA1.Rem=TABLA2.Rem ORDER BY PARTE1 ASC",$dbh) 
        or die("Problemas en el select:".mysql_error()); 

        echo "<table border=0 width='700px'>"; 
            echo "<tr> 
                    <td><strong># de Parte Original</strong></td> 
                    <td><strong>Cantidad Original</strong></td> 
                    <td><strong># de Parte Sustituci&oacute;n</strong></td> 
                    <td><strong>Cantidad Sustituci&oacute;n</strong></td> 
                    <td><strong>Diferencias</strong></td> 
                  </tr>"; 
            while ($row=mysql_fetch_array($conn)){ 
                $_varA = $row['PARTE1']; 
                $_varB = $row['CANT1']; 
                $_varC = $row['PARTE2']; 
                $_varD = $row['CANT2']; 
                  
                if ($_varB != $_varD) { 
                    $resultado = $_varB - $_varD; 
                    echo "<tr>"; 
                    echo "<td>".$_varA."</td>"; 
                     echo "<td align='center'>".$_varB."</td>"; 
                     echo "<td>".$_varC."</td>"; 
                     echo "<td align='center'>".$_varD."</td>"; 
                     echo "<td>".$resultado."</td>"; 
                     echo "</tr>"; 
                } else{} 
                 
            }      
            
            echo "</table>";  
   

De esta manera sólo añade las líneas de las facturas cuyas cantidades hayan cambiado incluyendo los números de parte anterior y nuevo.