Guardar consulta en tabla sin que se repitan resultados

[gnzsoloyo]

¿Detalle1 es la PK de la tabla?
Entonces usa REPLACE en lugar de INSERT:

Código MySQL:

REPLACE INTO tabla(Detalle1, total)
SELECT Detalle1, count(Detalle1) total 
FROM padron
GROUP BY Detalle1
 

De lo contrario danos más detalles de cómo haces ese insert y cómo es la estructura de la tabla destino..