Guardar consulta en tabla sin que se repitan resultados

[gnzsoloyo]

Por supuesto que no te va a insertar nada. UPDATE no inserta, actualiza.
No puedes hacer lo que quieres en una única consulta. Tienes que hacerlo en dos:
1) Insertar.

Código SQL:

INSERT IGNORE INTO tabla(Detalle1, total)
SELECT Detalle1, 0 total 
FROM padron
GROUP BY Detalle1
 

2) Actualizar:

Código MySQL:

UPDATE operadores O
   INNER JOIN (SELECT Detalle1, count(Detalle1) total 
        FROM padron
        GROUP BY Detalle1) P ON O.Operador = P.Detalle1
SET O.Movilizados = (O.movilizados + P.total);
 

El problema esencial es que no tiene mucho sentido hacer lo que quieres. Estás almacenando un campo calculado, cuando lo único que necesitas es hacer una consulta con JOIN.
Una de las primera cosas que se enseña en BBDD, es que no se guardan en tablas valores que se pueden obtener con consultas. No tiene ni utilidad ni sentido, y sólo te meten en este tipo de bretes.

¿Qué es lo que conceptualmente necesitas obtener?