Cita:
Iniciado por informacionsys 
gracias por la aclaracion..
Viendo el proceso despues de que la funcion retorna el arreglo final se recorre para la insercion ,
Retornas un array para hacer una insercion?
Para qué creas el array con todo el fichero??
Lee hasta un maximo de x filas, compones un insert con esas x filas, y lo ejecutas.
Luego lees x más.
Lo que comenta
pateketrueke se hace muy fácilmente con fastcgi_finish_request en caso de que estés usando php con fastcgi.