¿Y no te has puesto a pensar que usar una expresión regular (que es para texto) sobre un archivo binario no es solución correcta?
Es decir, ¿si sabes que es peligroso modificar datos binarios como si fuera texto?
Mejor busca una librería real para manejo de archivos multimedia, tal vez con FFMPEG podrías recortar el audio hasta cierta cantidad de bytes o segundos, etc.