Creo que no se entendio bien mi problema,
Es un sistema de encuestas llamado limesurvey
http://www.limesurvey.org/es/ , el sistema por cada encuesta que se realiza crea una tabla por ej;
tabla_idencuesta = tabla_1234
el modelo entidad relacion del sistema :
http://manual.limesurvey.org/LimeSur..._documentation
donde guarda las respuestas de la encuesta
La encuesta es tan extensa que el numero de columnas supera lo que soporta mysql mysam
Saludos