La cosa no es de coletilla, sino de los parámetros que aceptan los subformatos PDF-X1a y PDF-X3 que son los estándares de impresión.
Cita: PDF/X-1a
PDF/X-1a is designed to provide the most robust and, to some extent, least flexible delivery of PDF content data. It requires that the color of all objects be expressed in CMYK or spot colors, all prepared for the print conditions under which the final press-work will be run. Elements in RGB and Lab color spaces or tagged with ICC profiles are prohibited. It also requires that all fonts used in the job be embedded in the supplied PDF file and disallows the use of transparency and layers (optional content).
PDF/X-3
PDF/X-3 allows slightly more flexibility in that color managed workflows are also supported: elements in Lab, and RGB or CMYK images with attached ICC source color profiles may also be used, but transparency and layers are still prohibited.
http://www.globalgraphics.com/technology/pdfx/
Los PDF-X4 No son estándard en todos lados. No es lo mismo a PDF 1.4.
El problema con las transparencias es el modo de fusión. ¿Estás dispuesto a arriesgarte si tu modo de fusión es multiply y te lo interprete como normal? Los modos de fusión add, reaccionan diferente si es rgb o cmyk, ¿estás dispuesto a que el color resultante se salga de gamma o se bandee?
No sé cuantos abren un pdf ya generado para salida. Normalmente este es el último paso. Bueno pues esos archivos de salida lo que acaban haciendo, específicamente en corel es rasterizando los efectos. Sombras y cosas así los acaba convirtiendo en un mapa de bits plano sin transparencia al doble de resolución, pero sin alisado, por ejemplo.