Más allá d elo que dices, tienes un error grave de sintaxis en la creación de la query:
Código MySQL:
Ver originalVALUES ($value
->json_filed1
, $value
->json_field2
,) -- <-- Hay una com a de más al final.
Estás intentando insertar dos campos, con dos valores del array, pero estás poniendo una coma de más en el VALUES.
Por otro lado, esa query sólo funcionará bien si el contenido de $value->json_filed1 y $value->json_field2 son números. Si contiene cadenas de caracters se producirá un error de columna desconocida.