Cita: Esta extensión ya no está disponible en Windows con PHP 5.3 o posterior. SQLSRV, una extensión alternativa para conectividad con MS SQL está disponible desde Microsoft.
Posiblemente ese sea el problema.
Una recomendación es usar el driver de SQLSRV, necesitarás identificar si tu instalación de PHP es TS o NTS y tu versión de VC++.
PHP Extension Build API20100525,TS,VC9 (en caso mío)
Instalar la extensión php_sqlsrv_54_ts.dll, habilitarla e configurar en el PHP.ini
De igual forma deberás instalar
Microsoft SQL Server Native Client (x86)
Recuerda que los PHP drivers no pueden instalarse utilizando Apache x64 sólo para x86.
Una vez instalados solo deberás cambiar tus funciones en tú código de mssql_connect a sqlsrv_connect que verás en su página de documentación.
Saludos.