Esto está mal:
Código Javascript
:
Ver originaltaElem.setAttribute("href", "paginaDestino.php?variable=var[j][0]");
Porque tratas a la variable como una cadena al dejarla dentro de las comillas. Debes de dejar afuera y concatenarla con el resto:
Código Javascript
:
Ver originaltaElem.setAttribute("href", "paginaDestino.php?variable=" + var[j][0]);
Saludos