Diferencia de Tiempo entre fechas

[MatiasFiermarin]

Buenas, hace un tiempo me dieron una solución para calcular la diferencia de tiempo entre 2 fechas de formato (dd-mm-yyyy hh-mm-ss) que me sirvió pero tengo un problema.

Primero voy a describir las tablas.

Tabla "Excel" (Tabla donde se cargan los datos del reloj)
- Id
- cedula
- nombre
- hora (del formato dicho anteriormente)
- Forma_Ingreso (Huella Digital o Manual)
- entrada ( I o O Int - Out en otras palabras)
- fecha

De esta table cree 2 vistas para separar las entradas y las salidas

v_entrada
v_salida

Luego de esto cree otra vista que seria un intersect de las dos para sacar los registros que tienen salida y entrada y no solo entrada o solo salida.

Ejemplo si hay un registro de entrada del día 05-08-2014 pero no hay salida para este día no se toma en cuenta.

Aquí surge mi primer problema ya que un empleado puede entrar a las 18:00:00 del día 05-08-2014 y salir a las 00:00:00 del día 06-08-2014.

luego para calcular la diferencia de tiempo entre entrada y salida hago lo siguiente

Código PHP:

function RegistrarHorarios(){
    $datos=Seleccionar("v_todo","*","fecha BETWEEN '".$_POST['fecha1']."' AND '".$_POST['fecha2']."' GROUP BY cedula");
    $cedula;
    $id;
    $horastrab;
    $texto = "";
    while ($row=mysql_fetch_array($datos)) {
        $cedula = $row['cedula'];
        $datos2=Seleccionar("empleados","*","Cedula=".$cedula."");
        while($row2=mysql_fetch_array($datos2)){
            $id= $row2['IdEmpleado'];
        }
        if($id==''){
        }else{  
            $datos3=Seleccionar("empleadosector a1, sector a2","*","a1.IdEmpleado=".$id." AND a1.IdSector=a2.IdSector");
            if(mysql_num_rows($datos3)!=0){
                while($row2=mysql_fetch_array($datos3)){
                    $horastrab = $row2['Horas'];
                    break;
                }
                $datos5=Seleccionar("v_todo","fecha, SEC_TO_TIME(SUM(TIME_TO_SEC(TotalHoras))) AS Total","cedula=".$cedula." AND fecha BETWEEN '".$_POST['fecha1']."' AND '".$_POST['fecha2']."' GROUP BY fecha");
                while($row3=mysql_fetch_array($datos5)){
                    $horastrabajadas = $row3['Total'];
                    //return "Cedula ". $cedula ." id ". $id ."Horas de trab ".$horastrab." horas trabajadas ".$horastrabajadas;
                    $diferenciatiempo = Seleccionar("","TIMEDIFF('".$horastrabajadas."','".$horastrab."') AS Horas","");
                    while($row2=mysql_fetch_array($diferenciatiempo)){
                        $horasdetrab2 = $row2['Horas'];
                        $horasccte = Seleccionar("ccte","DiferenciaTiempo","Id_Empleado=".$id);
                        while($ccte=mysql_fetch_array($horasccte)){
                            $horaccte = $ccte['DiferenciaTiempo'];
                            //$texto = $texto." Cedula ". $cedula ." id ". $id ." Horas de trab ".$horastrab." horas trabajadas ".$horastrabajadas."DIFERENCIA ".$horasdetrab2." CCTE ".$horaccte;
                            $actualizoccte=Modificar("ccte","DiferenciaTiempo=ADDTIME('".$horaccte."','".$horasdetrab2."')","Id_Empleado=".$id);
                            break 3;
                        }
                    }
                }
            }else{
                $datos4=Seleccionar("empleadosector_rot a1, sector_rot a2","*","a1.IdEmpleado=".$id." AND a1.IdSector_Rot=a2.IdSector_Rot");
                while($row2=mysql_fetch_array($datos4)){
                    $horastrab = $row2['Horas'];
                    break;
                }
                $datos5=Seleccionar("v_todo","fecha, SEC_TO_TIME(SUM(TIME_TO_SEC(TotalHoras))) AS Total","cedula=".$cedula." AND fecha BETWEEN '".$_POST['fecha1']."' AND '".$_POST['fecha2']."' GROUP BY fecha");
                while($row3=mysql_fetch_array($datos5)){
                    $horastrabajadas = $row3['Total'];
                    //return "Cedula ". $cedula ." id ". $id ."Horas de trab ".$horasdetrab." horas trabajadas ".$horastrabajadas;
                    $diferenciatiempo = Seleccionar("","TIMEDIFF('".$horastrabajadas."','".$horastrab."') AS Horas","");
                    while($row2=mysql_fetch_array($diferenciatiempo)){
                        $horasdetrab2 = $row2['Horas'];
                        $horasccte = Seleccionar("ccte","DiferenciaTiempo","Id_Empleado=".$id);
                        while($ccte=mysql_fetch_array($horasccte)){
                            $horaccte = $ccte['DiferenciaTiempo'];
                            //$texto = $texto." Cedula ". $cedula ." id ". $id ." Horas de trab ".$horastrab." horas trabajadas ".$horastrabajadas."DIFERENCIA ".$horasdetrab2." CCTE ".$horaccte;
                            $actualizoccte=Modificar("ccte","DiferenciaTiempo=ADDTIME('".$horaccte."','".$horasdetrab2."')","Id_Empleado=".$id);
                            break 3;
                        }
                    }
                }
            }
        }
    }
    return "Horas Registradas";
}
 

El tema es que me calcula las horas pero si tengo 4 registros 2 I y 2 O siendo de el siguiente modo.

1) I
2) O
3) I
4) O

Me calcula el tiempo de 1 con el 2 y del 3 con el 4 (esto esta bien) y luego del 1 con el 4 y el 3 con el 2 en otras palabras todas las combinaciones, alguien me puede ayudar con estos dos problemas?

Gracias.