Servidor de Aplicaciones Windows con Linux

[morfil]

Amigos, por favor ayudenme con el siguiente problema,
De antemano pido disculpas si puse el tema en la sección equivocada además de agradecer a las personas que me puedan ayudar.

Tengo instalado una aplicación que solo funciona con el sistema Operativo Windows 7 y bueno deseo acceder a él desde un par de máquinas con sistema Operativo Kubuntu 14.04, le instale ULTRAVNC en la Windows para acceder remotamente, pero el problema es que cuando accedo desde una computadora con Kubuntu perfecto y al iniciar sesión VNC desde la otra pc con Kubuntu la computadora "servidor" hace caso a las dos computadoras. ¿Hay alguna forma de iniciar sesión de forma independiente para cuando al empezar pida que usuario de la pc con Windows utilizaremos?

Espero haber sido claro, muchas gracias.